一、數據變化不符合預期
在測定之前，用戶通常會根據參考文獻，或者此前自己實驗室的相關測定結果，對本次測定結果有一個預期變化趨勢。但是，有時會出現實際測定數據的變化趨勢不符合預期的情況。
1.檢查預期的依據
從生命科學研究來看，在預期的基礎上進行研究方案設計和準備樣本。但是這樣的預期一定要建立在堅實的依據上。
因此，當測定數據不符合預期時，首先應該回顧檢查當初提出這樣預期的依據是否堅實，不能刻舟求劍。
為什么在提出預期之后還要做實驗和測定呢？因為預期只是預期，并不是事實。預期能否成立，還行必須通過實驗來加以驗證。
2. 檢查測定數據的技術重復性和樣本重復性
先查找技術重復性，以及計算公式和單位，有沒有問題；如果沒有問題，再看樣本重復性，如實查找樣本質量有沒有問題；如果兩者都沒有問題，那么就必須接受測定結果，而不是刻舟求劍！此時要做的是，如何解釋結果。有時不符合預期，反而意味著研究的新意，甚至是新發現。
3.代謝及其調控往往是立體和網絡狀的
尤其值得注意的是，代謝及其調控往往是立體和多通路的。因此某種處理并不必然導致某個指標發生顯著變化，包括特定化學物質的處理、轉基因和基因敲除等情況。因此，出現預期之外的結果是很有可能的。
例如，一個細胞中某種成分的含量會取決于三種平衡：輸入與輸出，合成與降解，游離態與結合態。上述三種平衡中，任何一種平衡的偏離都可能造成該成分含量的變化。當然，還存在補償效應，該成分含量沒有變化，也不等于三種平衡就一定沒有偏離。何況，參與合成的有多種酶，參與降解的同樣有多種酶，因此該成分含量的變化，就有多種可能造成，存在多種不同的組合。
4.分析密切相關指標的變化
如果選擇了測定系列指標，那么由于這些指標密切相關，就可以通過相關指標的變化趨勢是否一致，來判斷該指標的變化是否正常，因為同時幾個相關指標變化都不正常的可能性比較小。另外，其它指標的變化能否解釋不符合預期的這個指標的實際變化趨勢等。
5.改變分母，重新計算數據
就某種測定指標而言，其變化趨勢除了與分子本身的變化趨勢有關外，還受到分母變化趨勢的很大影響。
原則上，為了準確反映該指標的變化趨勢，應該選擇在取樣周期內不發生顯著變化的另一個指標作為分母。如果取樣周期內作為分母的指標本身變化激烈，就會顯著改變分子的變化趨勢；如果分母變化不規律，就會導致分子變化也缺乏規律。
常用的分母包括鮮重、干重、可溶性蛋白質含量、細胞數量和器官與個體的數量等等。比較罕見的還要DNA含量等等。有時候換種分母，重新計算，分子就會呈現出某種變化規律。
值得指出的是，除了考慮分母在取樣周期內是否發生變化外，還需要考慮生理意義。例如，測定酶活性時常用可溶性蛋白質含量作為分母。但是，這是對生化中酶的比活力概念的誤用，因為此處用的是可溶性蛋白質含量，而不是該種酶蛋白的含量，該種酶蛋白只占粗酶液中可溶性蛋白質的很少一部分。如果樣本可溶性蛋白質含量不發生顯著變化還好，如果發生了顯著變化，就會導致酶活性變化趨勢發生顯著改變。更加重要的是，酶的比活力對于研究酶本身是有意義的，但是對于某種生物學現象而言，更加關注的是該酶的生理功能，此時用鮮重作為分母，應該更能反映該酶在此種生物學現象中的生理功能。
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